职  称:讲师
研究方向:生物信息学
办公电话:
办公地点:东北师范大学信息科学与技术学院219
电子邮件:sunpp567@nenu.edu.cn

个人简历

东北师范大学信息科学与技术学院讲师、硕士生导师。2005年本科毕业于东北师范大学计算机学院,2008年获得东北师范大学计算机学院计算机软件与理论专业硕士学位,2011年获得东北师范大学化学学院物理化学专业博士学位。2017年细胞生物学专业博士后出站。自2005年开始一直从事智能计算及生物信息学等领域的研究。主要研究背景为蛋白质相互作用预测、蛋白交互网络及生物药物辅助设计。承担本科生《编译原理》、《信息技术》课程的教学工作。承担并参与完成国家、省部和市级科研项目十余项。在国际、国内重要学术期刊发表论文30余篇。自2012年起,共指导培养硕士研究生12名。

社会兼职

获奖情况

  • 获奖情况:
    2013-12-16 吉林省科学技术奖自然科学奖二等奖
    2013年 吉林省自然科学学术成果奖一等奖

教学信息

  • 教学信息:
    本科生:编译原理、生物信息学、信息技术1、信息技术2(网络应用基础)
    研究生:生物信息学

科研信息 (数据来源:科学技术处、社会科学处)

  • 项目:
  • 1. 基于深度图卷积的B细胞表位预测及其在冠状病毒S蛋白上的应用研究,2021年
  • 2. 基于深度增强学习的癌症个体化诊疗中多驱动突变作用研究,2020年
  • 3. 基于抗原结构和模拟表位的B细胞表位预测算法研究,2019年
  • 4. 基于多信息融合的构象性B细胞表位预测模型和算法研究,2018年
  • 论文:
  • 1. Current Advances and Limitations of Deep Learning in Anticancer Drug Sensitivity Prediction,CURR TOP MED CHEM,2020年
  • 2. DMCTOP: Topology Prediction of Alpha-Helical Transmembrane Protein Based on Deep Multi-Scale Convolutional Neural Network,2019IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM),2019年
  • 3. B-cell Epitope Prediction Method based on Deep Ensemble Architecture and Sequences,2019IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM),2019年
  • 4. DeepMRMP: A new predictor for multiple types of RNA modification sites using deep learning,MATH BIOSCI ENG,2019年
  • 5. Advances in In-silico B-cell Epitope Prediction,CURR TOP MED CHEM,2019年
  • 6. Prediction of Protein-Protein Interaction Based on Weighted Feature Fusion,LETT ORG CHEM,2019年
  • 7. Understanding Membrane Protein Drug Targets in Computational Perspective,CURR DRUG TARGETS,2019年
  • 8. A Sequential Segment Based Alpha-Helical Transmembrane Protein Alignment Method,INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL SCIENCES,2018年
  • 9. Protein Function Prediction Using Function Associations in Protein-protein Interaction Network,IEEE ACCESS,2018年
  • 10. Prediction of conformational B-cell epitope binding with individual antibodies using phage display peptides,INTERNATIONAL JOURNAL OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL MEDICINE,2016年
  • 11. A novel conformational B-cell epitope prediction method based on mimotope and patch analysis,J THEOR BIOL,2016年
  • 12. The Relationship Between B-Cell Epitope and Mimotope Sequences,PROTEIN PEPTIDE LETT,2016年
  • 13. Conformational B-cell epitope prediction method based on antigen preprocessing and mimotopes analysis,BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL,2015年
  • 14. Prediction of protein solvent accessibility using PSO-SVR with multiple sequence-derived features and weighted sliding window scheme,BIODATA MINING,2015年
  • 15. PECM: Prediction of extracellular matrix proteins using the concept of Chou’s pseudo amino acid composition,J THEOR BIOL,2014年
  • 16. PSNO: Predicting Cysteine S-Nitrosylation Sites by Incorporating Various Sequence-Derived Features into the General Form of Chou’s PseAAC,INT J MOL SCI,2014年
  • 17. Conformational B-Cell Epitopes Prediction from Sequences Using Cost-Sensitive Ensemble Classifiers and Spatial Clustering,BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL,2014年
  • 18. A Topology Structure Based Outer Membrane Proteins Segment Alignment Method,MATH PROBL ENG,2013年
  • 19. Identification of Protein Pupylation Sites Using Bi-Profile Bayes Feature Extraction and Ensemble Learning,MATH PROBL ENG,2013年
  • 20. Position-Specific Analysis and Prediction of Protein Pupylation Sites Based on Multiple Features,BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL,2013年
  • 21. Bioinformatics Resources and Tools for Conformational B-Cell Epitope Prediction,COMPUTATIONAL AND MATHEMATICAL METHODS IN MEDICINE,2013年
  • 22. Prediction of antigen epitopes on protein surfaces based on support vector machine,Advanced Materials Research,2012年
  • 23. 基因非编码区与转录调控元件的识别研究,生物信息学,2008年
  • 24. 改进的K-mean聚类算法在基因系统发育谱分析中的应用,生物信息学,2008年
  • 25. Application of Improved K-mean Clustering in predicting protein-protein interactions,BioMedical Engineering and Informatic(BMEI2008),2008年
  • 26. Research of Improved Phylogenetic Profiling Method,Bioinformatics and Biomedical Engineering(ICBBE2008),2008年
  • 27. Predicting protein-protein interactions based on BP neural network,2007 BIBM IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine,2007年
  • 28. 识别转录因子结合位点的新方法,吉林大学学报(理学版)特刊,2006年
信息维护