何飞

项目：
1. 基于胶囊网络的蛋白对接候选复合物排序研究，省、市、自治区科技项目，2021年
2. 面向动态蛋白质交互组网络的复合深度学习模型研究，省、市、自治区科技项目，2018年
3. 融合多视角3D深度描述子的靶蛋白-配体复合物活性预测研究，国家自然科学基金项目，2018年
4. 具有自适应自学习特性的纹理Gabor深度学习网络研究，省、市、自治区科技项目，2017年
5. 大规模纹理分类的深度Gabor卷积神经网络构建，自选课题，2016年
论文：
1. THPLM: a sequence-based deep learning framework for protein stability changes prediction upon point variations using pretrained protein language model，BIOINFORMATICS，2023年
2. Deciphering and identifying pan-cancer RAS pathway activation based on graph autoencoder and ClassifierChain，ELECTRONIC RESEARCH ARCHIVE，2023年
3. Applications of cutting-edge artificial intelligence technologies in biomedical literature and document mining，Medical Review，2023年
4. Define and visualize pathological architectures of human tissues from spatially resolved transcriptomics using deep learning，COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL，2022年
5. Sampling and ranking spatial transcriptomics data embeddings to identify tissue architecture，FRONTIERS IN GENETICS，2022年
6. Discover the Binding Domain of Transmembrane Proteins Based on Structural Universality，2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)，2021年
7. Identifying Genes and Their Interactions from Pathway Figures and Text in Biomedical Articles，2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)，2021年
8. An Ensemble Deep Learning based Predictor for Simultaneously Identifying Protein Ubiquitylation and SUMOylation Sites，BMC BIOINFORMATICS，2021年
9. Machine learning methods in prediction of protein palmitoylation sites: A brief review，CURR PHARM DESIGN，2021年
10. A multi-view clustering algorithm for mixed numeric and categorical data，IEEE ACCESS，2021年
11. MU-PseUDeep: A deep learning method for prediction of pseudouridine sites，COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL，2020年
12. MusiteDeep: a deep-learning based webserver for protein post-translational modification site prediction and visualization，NUCLEIC ACIDS RESEARCH，2020年
13. Clustering Mixed Numeric and Categorical Data With Cuckoo Search，IEEE ACCESS，2020年
14. Phenotype prediction and genome-wide association study using deep convolutional neural network of soybean，FRONTIERS IN GENETICS，2019年
15. Protein Ubiquitylation and Sumoylation Site Prediction Based on Ensemble and Transfer Learning，2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM)，2019年
16. DeepMRMP: A new predictor for multiple types of RNA modification sites using deep learning，MATH BIOSCI ENG，2019年
17. MPLs-Pred: Predicting Membrane Protein-Ligand Binding Sites Using Hybrid Sequence-Based Features and Ligand-Specific Models，INT J MOL SCI，2019年
18. Clustering mixed numeric and categorical data with artificial bee colony strategy，J INTELL FUZZY SYST，2019年
19. Understanding Membrane Protein Drug Targets in Computational Perspective，CURR DRUG TARGETS，2019年
20. Large-scale prediction of protein ubiquitination sites using a multimodal deep architecture，BMC SYSTEMS BIOLOGY，2018年
21. General and Species-Specific Lysine Acetylation Site Prediction Using a Bi-Modal Deep Architecture，IEEE ACCESS，2018年
22. 基于模糊质心的混合属性数据模糊加权聚类算法，计算机科学，2018年
23. A Multimodal Deep Architecture for Large-Scale Protein Ubiquitylation Site Prediction，2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM)，2017年
24. Effective small interfering RNA design based on convolutional neural network，2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM)，2017年
25. Predicting siRNA efficacy based on multiple selective siRNA representations and their combination at score level，SCIENTIFIC REPORTS，2017年
26. Deep learning architecture for iris recognition based on optimal Gabor filters and deep belief network，J ELECTRON IMAGING，2017年
27. Utilizing Selected Di- and Trinucleotides of siRNA to Predict RNAi Activity，COMPUTATIONAL AND MATHEMATICAL METHODS IN MEDICINE，2017年
28. Face-iris multimodal biometric scheme based on feature level fusion，J ELECTRON IMAGING，2015年
专利：
多源生物大数据融合系统 2021-08-24