职  称:副教授
研究方向:大数据分析、计算机视觉、推荐系统
办公电话:15943006836
办公地点:计算机学院二楼221A

个人简历

2010/09-2013/07,东北师范大学,计算机科学与信息技术学院,博士 2013/07-2015/07,东北师范大学,数学与统计学院,统计学,博士后 2013/07-2021/06,东北师范大学,计算机科学与信息技术学院,讲师 2021/06-至今, 东北师范大学,信息科学与技术学院,副教授 研究方向:大数据分析技术,推荐系统,计算机视觉 优秀毕业生去向: 中国人民解放军军事医学研究院 招商银行 北京市地震监测与信息中心 长春市公安局 大连海事大学 东北师范大学 项目情况: 1. 中国博士后基金第八批特别资助,2015T80285,蛋白质翻译后修饰特异性预测的特征抽取及学习算法研究,15万元,主持 2. 中国博士后基金面上项目一等资助,2014M550166,蛋白质翻译后修饰位点预测的特征抽取和学习算法研究,8万元,主持 3. 国家自然科学基金青年项目,61403077,蛋白质翻译后修饰位点物种特异性预测的特征抽取和学习算法研究,25万元,主持 4. 国家自然科学基金青年项目,61402098,人类膜蛋白交互组网络构建,26万,参加 5. 吉林省自然科学青年基金,20150520061JH、蛋白质相互作用热点残基及热区识别算法研究,6万元,主持 6. 东北师大-百度 第二期教育部供需对接就业育人校企合作项目,2023年 获奖情况: 中国大学生计算机设计大赛,国家二等奖,2022年。 论文情况: (1) Compressing biomedical knowledge graph embedding with multi-level knowledge distillation for drug-target interaction prediction. 2024, Information Science, under review.(JCR1区,中科院1区,Top期刊) (2) Zhao XS, Wu J, Zhao XW*, Yin MH.Multi-view contrastive heterogeneous graph attention network for lncRNA–disease association prediction. Briefings in Bioinformatics, 2023, 24(1),1-14.(JCR1区,中科院2区,IF= 11.622,Top期刊) (3) Zhao XS, Zhao XW*, Yin MH. Heterogeneous Attention Network based on Meta-paths for disease association prediction. Briefings in Bioinformatics, 2022, 23(1): 1-13. (JCR1区,中科院2区,IF= 11.622,Top期刊) (4) Ning Q, Ma Z, Zhao XW*. SSKM_Succ: A novel succinylation sites prediction method incorporating K-means clustering with a new semi-supervised learning algorithm. IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2022, 19(1):643-652. (CCF推荐B类期刊) (5) Ning Q, Zhao XW*. A novel method for Identification of Glutarylation sites combining Borderline-SMOTE with Tomek links technique in imbalanced data. IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2022, In Press. (CCF推荐B类期刊) (6) Zhao XW, Yang YQ, Yin MH. MHRWR: Prediction of lncRNA-disease associations based on multiple heterogeneous networks. IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2021,18(5):1-9. (CCF推荐B类期刊) (7) Yue L, Shen H, Wang S, BOOTS R, Long GD, Chen WT, Zhao XW*. Exploring BCI Control in Smart Environment: Intention Recognition via EEG Representation Enhancement Learning. ACM Transactions on Knowledge Discovery from Data, 2021,15(5): 1-20. (CCF推荐B类期刊) (8) Yue L, Zhao HN, Yang YQ, Tian DY, Zhao XW*, Yin MH. A Mimic Learning Method for Disease Risk Prediction with Incomplete Initial Data. International Conference on Database Systems for Advanced Applications(DASFA), 2019. (CCF推荐B类会议)

社会兼职

获奖情况

  • 2013年获得吉林省自然科学学术成果一等奖。

教学信息 (数据来源:教务处)

  • 离散数学
  • 信息技术2(网络应用基础)
  • 信息科学前沿(软件工程)
  • 信息科学研究方法课
  • 信息科学前沿(计算机)
  • 信息科学研究方法课(计算机专业)
  • 信息科学前沿(计算机学硕)
  • 数学类1班
  • 马部1班
  • 环境2班
  • 音乐学院(网络应用基础web)
  • 大数据分析技术
  • 信息技术2(网络应用基础)重修班
  • 离散数学(中美)
  • 信息技术2(算法与程序设计基础—提高班)地理非师
  • 生科1班
  • 美术3班(网络应用基础)
  • 信息技术2(算法与程序设计基础—提高班)生科2班

科研信息 (数据来源:科学技术处、社会科学处)

  • 项目:
  • 1. 蛋白质翻译后修饰位点预测的特征抽取和学习算法研究,其他课题,2019年
  • 2. 蛋白质翻译后修饰特异性预测的特征抽取和学习算法研究,其他课题,2019年
  • 3. 蛋白质翻译后修饰位点特异性识别的生物信息学方法研究,省、市、自治区科技项目,2016年
  • 4. 蛋白质相互作用界面热点残基及热区识别算法研究,省、市、自治区科技项目,2015年
  • 5. 蛋白质翻译后修饰位点物种特异性预测的特征抽取和学习算法研究,国家自然科学基金项目,2014年
  • 6. 蛋白质相互作用界面热点残基预测的特征抽取及识别算法研究,其他课题,2014年
  • 论文:
  • 1. Multi-view contrastive heterogeneous graph attention network for lncRNA-disease association prediction,BRIEF BIOINFORM,2023年
  • 2. A novel method for Identification of Glutarylation sites combining Borderline-SMOTE with Tomek links technique in imbalanced data,IEEE ACM T COMPUT BI,2022年
  • 3. Heterogeneous graph attention network based on meta-paths for lncRNA-disease association prediction,BRIEF BIOINFORM,2022年
  • 4. SSKM_Succ: A Novel Succinylation Sites Prediction Method Incorporating K-Means Clustering With a New Semi-Supervised Learning Algorithm,IEEE ACM T COMPUT BI,2022年
  • 5. MHRWR: Prediction of lncRNA-disease associations based on multiple heterogeneous networks,IEEE ACM T COMPUT BI,2021年
  • 6. An Ensemble Deep Learning based Predictor for Simultaneously Identifying Protein Ubiquitylation and SUMOylation Sites,BMC BIOINFORMATICS,2021年
  • 7. Exploring BCI Control in Smart Environments: Intention Recognition Via EEG Representation Enhancement Learning,ACM TRANSACTIONS ON KNOWLEDGE DISCOVERY FROM DATA,2021年
  • 8. A multi-view clustering algorithm for mixed numeric and categorical data,IEEE ACCESS,2021年
  • 9. Clustering Mixed Numeric and Categorical Data With Cuckoo Search,IEEE ACCESS,2020年
  • 10. Protein Ubiquitylation and Sumoylation Site Prediction Based on Ensemble and Transfer Learning,2019 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM),2019年
  • 11. Analysis and prediction of human acetylation using a cascade classifier based on support vector machine,BMC BIOINFORMATICS,2019年
  • 12. A Mimic Learning Method for Disease Risk Prediction with Incomplete Initial Data,24th International Conference on Database Systems for Advanced Applications, DASFAA 2019,2019年
  • 13. dForml(KNN)-PseAAC: Detecting formylation sites from protein sequences using K-nearest neighbor algorithm via Chou's 5-step rule and pseudo components,J THEOR BIOL,2019年
  • 14. Clustering mixed numeric and categorical data with artificial bee colony strategy,J INTELL FUZZY SYST,2019年
  • 15. Identifying N6 -methyladenosine sites using extreme gradient boosting system optimized by particle swarm optimizer,J THEOR BIOL,2019年
  • 16. Large-scale prediction of protein ubiquitination sites using a multimodal deep architecture,BMC SYSTEMS BIOLOGY,2018年
  • 17. General and Species-Specific Lysine Acetylation Site Prediction Using a Bi-Modal Deep Architecture,IEEE ACCESS,2018年
  • 18. Detecting Succinylation sites from protein sequences using ensemble support vector machine,BMC BIOINFORMATICS,2018年
  • 19. An Improved Binary Differential Evolution Algorithm for Feature Selection in Molecular Signatures,Molecular Informatics,2018年
  • 20. 基于模糊质心的混合属性数据模糊加权聚类算法,计算机科学,2018年
  • 21. A Multimodal Deep Architecture for Large-Scale Protein Ubiquitylation Site Prediction,2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine(BIBM),2017年
  • 22. Glypre: In Silico Prediction of Protein Glycation Sites by Fusing Multiple Features and Support Vector Machine,MOLECULES,2017年
  • 23. EPuL: An Enhanced Positive-Unlabeled Learning Algorithm for the Prediction of Pupylation Sites,MOLECULES,2017年
  • 24. PPIs Meta: A Meta-predictor of Protein-Protein Interaction Sites with Weighted Voting Strategy,CURRENT PROTEOMICS,2017年
  • 25. Identification of S-glutathionylation sites in species-specific proteins by incorporating five sequence-derived features into the general pseudo-amino acid composition,J THEOR BIOL,2016年
  • 26. Prediction of "Aggregation-Prone" Peptides with Hybrid Classification Approach,MATH PROBL ENG,2015年
  • 27. Prediction of protein solvent accessibility using PSO-SVR with multiple sequence-derived features and weighted sliding window scheme,BIODATA MINING,2015年
  • 28. PECM: Prediction of extracellular matrix proteins using the concept of Chou’s pseudo amino acid composition,J THEOR BIOL,2014年
  • 29. PSNO: Predicting Cysteine S-Nitrosylation Sites by Incorporating Various Sequence-Derived Features into the General Form of Chou’s PseAAC,INT J MOL SCI,2014年
  • 30. Conformational B-Cell Epitopes Prediction from Sequences Using Cost-Sensitive Ensemble Classifiers and Spatial Clustering,BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL,2014年
  • 31. Identification of Protein Pupylation Sites Using Bi-Profile Bayes Feature Extraction and Ensemble Learning,MATH PROBL ENG,2013年
  • 32. Position-Specific Analysis and Prediction of Protein Pupylation Sites Based on Multiple Features,BIOMED RESEARCH INTERNATIONAL,2013年
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